1，低操作溫度。
不同的材料，在常規(guī)蒸餾沸點是依靠不良分離，分子蒸餾是依靠不同的材料進行分離分子運動自由程的差異，其結(jié)果是，后者是遠離（遠低于）下的沸點操作。
由于獨特的結(jié)構(gòu)形式的分子蒸餾裝置，內(nèi)部壓力，在高真空度可制得。同時，由分子運動式的自由路徑，以便獲得足夠的平均自由程，可通過減壓蒸餾獲得，一般為數(shù)量級XX 10-1巴順序。
從以上兩點，雖然在高真空度的常規(guī)的真空蒸餾可以采用的，但由于其結(jié)構(gòu)限制（特別是板式塔和填充塔）中，電阻為大得多的分子蒸餾裝置，因此，真空度和上述沸點的操作，所以它的操作溫度比分子蒸餾高得多。作為液體混合物在260℃真空蒸餾操作溫度和分子蒸餾只有約150℃。
3.加熱時間短。
鑒于分子蒸餾時，它是基于不同的材料的分子運動自由程的差異來實現(xiàn)加熱表面的分離，因而冷凝表面間距小于分子自由程的光的運動（即，短距離），從向冷凝表面液面所以小光分子碰撞逸出，使加熱時間短。另外，如果采用更先進的分子蒸餾結(jié)構(gòu)，液面的混合物來實現(xiàn)薄層，液面與加熱表面積幾乎相等，所以，在蒸餾時這段時間較短。假設(shè)的1小時后，將分子蒸餾中只有十個秒真空蒸餾加熱時間。
4.高程度的分離。
分子蒸餾通常用于分離常規(guī)的蒸餾來分離材料，但是，這兩種方法可以單獨在材料，更大程度分子蒸餾分離的方面。通用型的波動下，分子蒸餾說：
阿爾法的tau = P1 / P2（M 2 / M 1）1/2。 M1的類型作為光成分的分子量; M 2，分子量的主要組成部分; P1，P2，分別是組分1和2的蒸氣壓。
和α= P1 / P2的常規(guī)蒸餾的相對揮發(fā)性。在相同的P1 / P2，M2的分子量的重組大于光成分M的分子量，因此它比阿爾法tau蛋白的α。這表明，分子蒸餾與常規(guī)蒸餾容易分離相比，和為M1，M2的，更大的差別，分離的更大的程度。
從分子蒸餾技術(shù)上述可知的特點，它在實際的工業(yè)應用已與常規(guī)蒸餾技術(shù)相比以下明顯的優(yōu)點。
對于高沸點，熱敏感和容易氧化物質(zhì)的分離，分子蒸餾方法可提供最佳的分離。由于分子蒸餾的工作在非常低的溫度，并且加熱時間短;
分子蒸餾可以非常有效地除去低分子量物質(zhì)的液體（例如有機溶劑，氣味等），對于脫溶劑的溶劑提取液后使用是一個非常有效的方法;
可以選擇性地蒸出的目標產(chǎn)物，除去其他雜質(zhì)，通過多級分離可以分離兩種或更多種物質(zhì)的;
分子蒸餾的分離方法，是一種物理過程，因而能很好地保護材料免受污染和分離。與工業(yè)化的發(fā)展，分子蒸餾技術(shù)已廣泛應用于高附加值材料，自然物的特別的分離，因而被稱為自然品質(zhì)創(chuàng)造的優(yōu)勢者。